过刊目录

  • 全选
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    综述
  • 史华俊, 刘忠, 郭俊明
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 781-787.
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    近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA (long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注. lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录. lncRNA种类繁多,数量庞大,占哺乳动物基因组转录物的绝大部分. 相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNA的功能目前尚不完全清楚.但越来越多的研究发现,lncRNA在多个水平调控基因的表达,在胚胎发育、物种进化、细胞分化和某些疾病如神经退行性疾病及肿瘤的发生过程中起着重要作用. 本文在简要介绍lncRNA基本概念的基础上,结合当前研究成果,就lncRNA在转录水平、转录后水平和表观遗传水平调控基因表达的机制作一综述.
  • 谢兆辉
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 788-792.
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    在细菌中,mRNA降解具有重要的意义,它不仅可以再循环核苷酸,而且还可以根据生长条件的变化调控基因表达.细菌mRNA的降解机制可以分为3种:① mRNA的一般降解途径|② mRNA的质量控制途径|③ 小RNA介导的降解途径. 这些途径有些与真核生物的mRNA降解途径存在很大差异,有些在真核生物中消失了. 另外,mRNA降解途径还可以直接调控细菌致病因子的表达,这使得细菌mRNA的降解途径很有希望成为药物研发的新靶标,或疫苗制备的新平台,以应对越来越严重的细菌耐药性问题.本文综述了细菌mRNA的降解机制,并对其应用前景进行了展望.
  • 方晨, 黄惠芳, 邹伟
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 793-796.
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    tMicroRNAs (miRNAs) are small noncoding RNAs involved in regulating cellular proliferation, differentiation and signaling pathways. Recent researches reveal that miRNAs also play an important role in genes related to hepatic diseases. The different expression profiles of miRNA in hepatocellular carcinoma suggested that miRNA might serve as either novel potential targets acting directly as oncogenes or therapeutic molecular targets working as tumor suppressor genes. For better understanding the relationship between miRNAs and liver diseases and the prospects for therapy in future, this review summarizes the effects of miRNAs on hepatitis, alcoholinduced liver injury and hepatocellular carcinoma.
  • 王冠杰, 周波, 李玉花
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 797-803.
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    基于限制位点相关的DNA(restriction site associated DNA, RAD)标记的测序方法是一种新型的测序技术.其优点是不仅节省传统测序的试验成本,而且能快速准确的定位出数以千计的基因标记,从而更加适合分子辅助育种的应用.该方法可应用于寻找DNA多态性,鉴别SNP,构建未知基因组序列生物的遗传图谱,定位目的性状基因等.本文主要综述了RAD标记和RAD测序的研究进展及其在分子育种中的应用.
  • 研究论文
  • 李烨, 刘文锋, 刘如石, 印大中
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 804-810.
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    为了探索丙二醛(malonaldehyde, MDA)抑制间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)成骨分化的作用机制,用不同浓度的丙二醛孵育MSCs,进行成骨诱导培养,检测碱性磷酸酶活性和钙结节形成|并检测p38和JNK表达水平和磷酸化程度,用这两种信号分子的特异性阻断剂进行验证. 结果发现,丙二醛浓度依赖性地降低MSCs碱性磷酸酶的活性,抑制钙结节的形成|并引起p38和JNK的表达上调和磷酸化增强,诱导JNK由胞浆向胞核转位| p38和JNK阻断剂对丙二醛的上述效应有拮抗作用. 结果表明,丙二醛可抑制MSCs的成骨诱导分化,其作用机制涉及p38和JNK信号通路的参与.
  • 读者,作者,编者
  • 中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 810-810.
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    由我国生物化学前辈郑集教授和张昌颖教授出资,《中国生物化学与分子生物学报》特设“郑集优秀论文奖励基金”(1985年建立)、“张昌颖优秀论文奖励基金”(2006年建立),两年评选1次,每次评选8篇,奖励在本刊发表优秀论文的年轻作者。
    2012年全国生物化学与分子生物学学术大会8月24-26日在成都召开,大会闭幕式上颁发了2010—2011年度郑集-张昌颖奖励基金优秀论文奖。
    获奖优秀论文名单:
    1.杜欣,李晓青,杨帆,冯玉梅(天津医科大学附属肿瘤医院肿瘤研究所生物化学与分子生物学室,乳腺癌防治教育部重点实验室).采用系统生物学方法分析乳腺癌转移中Runx2对细胞外基质重塑的调节机制.中国生物化学与分子生物学报, 2010,26(5):462-471
    2.朱萍1),冯吉2),杨荟敏1),谷利1),张红1)(1)首都医科大学细胞生物学系; 2)首都医科大学化学生物学与药学院). 血清通过调节mGluR1介导的信号通路调控细胞的生长与凋亡.中国生物化学与分子生物学报, 2010,26(4)332-340
    3.端家忠1),张靖溥1),2),朱少侠1),李勇1)(1)中国科学院遗传与发育生物学研究所; 2)中国医学科学院医药生物技术研究所).Cwc15 家族同源基因mED1在小鼠早期胚胎发育中的表达模式.中国生物化学与分子生物学报,2010,26(7):637-642
    4.吴琦 1),2) , 冯田 1) , 孙希财 1), 林平 1) , 边淑玲1) , 赵雪飞1), 李聪 3) ,于晓光 1)(1)哈尔滨医科大学生物化学与分子生物学教研室;2)齐齐哈尔医学院生物化学与分子生物学教研室;3)哈尔滨医科大学附属肿瘤医院病理科). ADAM17通过EGFR-PI3K/Akt/p27通路调控前列腺癌细胞增殖.中国生物化学与分子生物学报, 2010,26(8)749-755
    5.路钊1),郑少鹏1),牛静1),贾弘禔1),2),丁卫1)(1)首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系|2) 北京大学医学部生物化学与分子生物学系).BATF2/SARI通过抑制p53依赖的NF-κB转录活性诱导肿瘤细胞凋亡.中国生物化学与分子生物学报, 2011,27 (6): 524-532
    6.刘宏德,孙啸(东南大学生物电子学国家重点实验室).核小体定位模式及其与DNA甲基化位点分布的关系. 中国生物化学与分子生物学报,2011,27(3):248-253
    7.易 婷1),2),张浩1),3), 彭宜红1),3),朱萌1),何晓燕1),黄孝天2)(1)北京大学医学部病原生物学系; 2)南昌大学医学院微生物学教研室; 3)北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室). MEK1-ERKs级联激活方式是调控单纯疱疹病毒II型复制的重要机制.中国生物化学与分子生物学报,2011,27(2):142-147
    8.山长亮,张帅,张晓东,叶丽虹 (南开大学生命科学学院,教育部生物活性材料重点实验室)乙肝病毒X蛋白突变体(HBx△127).通过ERK上调钙蛋白酶小亚基1促进肝癌细胞迁移.中国生物化学与分子生物学报,2011,27(5):426-430
  • 研究论文
  • 邹联洪, 徐勤枝, 刘晓丹, 王豫, 李兵, 钟才高, 周平坤
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 811-817.
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    TAB182是一个端锚聚合酶1(tankyrase 1)结合蛋白,它在体外能够被tankyrase 1发生二磷酸腺苷核糖基化(PAR)修饰,其生物学功能目前尚不明确.本研究发现,TAB182蛋白水平受电离辐射诱导表达,HeLa细胞经过4 Gy照射处理时,TAB182在2 h表达含量最高; 经过不同剂量照射处理,2 h后2 Gy、4 Gy照射剂量组HeLa细胞中TAB182的表达有明显增加. 通过shRNA沉默HeLa细胞中TAB182基因表达,导致其对4 Gy及以下剂量 辐射的敏感性增加,但对8 Gy大剂量照射的敏感性没有明显变化. 与对照组相比,4 Gy照射诱发TAB182基因沉默细胞的G2/M期阻滞时间显著延长.抑制TAB182表达导致细胞中DNA损伤反应蛋白DNAPKcs、ATM、Chk2的表达水平显著降低. 实验结果提示,TAB182蛋白参与放射DNA损伤信号反应和调控细胞周期G2/M进程.
  • 张洪, 安凡, 唐莉, 邱荣国
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 818-825.
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    研究新合成的新型埃博霉素单甲基衍生物对血管新生的影响,以期阐明埃博霉素在肿瘤细胞和血管新生中的效应及其所作用的重要途径,为药物新靶点的开发提供理论依据.首先,以人脐静脉内皮细胞为研究对象,利用MTT法检测细胞增殖,Transwell法检测细胞迁移和侵润,明胶酶谱分析金属基质蛋白酶MMP2的活性,RTPCR检测MMP2 RNA表达水平|然后以鸡胚绒毛尿囊膜为模型,研究该衍生物对血管新生的影响.结果表明:1)新型埃博霉素单甲基衍生物可以显著抑制人脐静脉内皮细胞HUVEC的增殖、迁移和侵润以及Ⅳ型胶原酶分泌; 2)新型埃博霉素单甲基衍生物可以使鸡胚尿囊膜产生明显的无血管区,对血管新生产生明显的抑制作用. 结果说明,新型埃博霉素单甲基衍生物可以通过抑制血管内皮细胞的增殖、迁移、侵润以及Ⅳ型胶原酶分泌等显著抑制诱导血管新生过程的步骤,最终抑制血管新生.
  • 冀芦沙, 郭尚敬, 于守超, 杨宗芳
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 826-834.
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    为了解高迁移率族蛋白B族(high mobility group protein B,HMGB)基因调控植物响应低温、高盐和干旱等外源胁迫的表达调控方式, 本文克隆了拟南芥AtHMGB前5个家族成员的启动子区域(PAtHMGB1,PAtHMGB2,PAtHMGB3,PAtHMGB4和PAtHMGB5).运用基因重组技术将其分别替换表达载体上35S启动子区域获得重组表达载体,利用农杆菌介导法侵染烟草获得稳定表达的转基因烟草. 运用实时定量PCR检测上述5种启动子的转基因烟草,观察在外源胁迫(低温、高盐和干旱)处理前后gusA基因的表达差异,同时检测转基因烟草种子在不同外源胁迫条件下的萌发状况. 检测结果证实,在低温胁迫下,PAtHMGB2,PAtHMGB3和PAtHMGB4正调控gusA基因的表达,而在干旱或盐胁迫下,gusA基因的表达被PAtHMGB2和PAtHMGB3负调控. 种子萌发结果表明,在干旱胁迫下,PAtHMGB2调控下的转基因烟草比野生型烟草萌发及生长迟缓|在低温胁迫下,PAtHMGB2调控的转基因烟草长势明显强于野生型. 本研究克隆了拟南芥AtHMGB家族前5个成员启动子,分析其生物学功能发现,PAtHMGB2在响应低温和干旱胁迫方面效果尤为显著.
  • 张志威, 陈月婵, 裴文宇, 王宁, 李辉
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 835-842.
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    脂肪细胞分化是脂肪组织发育的一个重要过程. 目前,鸡脂肪细胞分化的分子调控机制还不十分清楚. 哺乳动物的研究结果表明,转录因子GATA结合蛋白2(Gata2)和GATA结合蛋白3(Gata3)具有抑制脂肪细胞分化的功能,它们在白色脂肪组织和棕色脂肪组织中的表达模式不同. 鸡没有棕色脂肪组织,目前还没有关于Gata2 和Gata3作用于鸡脂肪细胞分化的研究报道. 本研究利用半定量RTPCR的方法分析了Gata2和Gata3基因在鸡腹部脂肪组织和前脂肪细胞中的表达规律,发现鸡腹部脂肪组织中高水平表达Gata2 基因,低水平表达Gata3基因|鸡前脂肪细胞中Gata2 基因的表达水平远高于Gata3基因的表达水平,油酸诱导分化后的鸡前脂肪细胞Gata2基因的表达水平明显下调.此外,鸡过氧化物酶体增殖体激活受体γ(Pparγ)启动子(-1985/-89)报告基因荧光素活性分析和半定量RTPCP发现,在DF1细胞中过表达Gata2 或Gata3抑制鸡PPARγ基因的转录. 本研究结果为进一步研究鸡脂肪细胞分化的分子调控机制和Gata2和Gata3基因的生物学功能提供了参考.
  • 李晋南, 张振宇, 王文飞, 陈睿, 赵景壮, 任桂萍, 李德山
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 843-849.
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    成纤维细胞生长因子21(fibroblast growth factor,FGF21)是FGF家族中的新成员.目前研究显示,FGF21是一个新的糖脂代谢调节因子,有望成为治疗糖尿病的新型药物.为探讨FGF21的生理功能,利用real-time PCR和Western印迹,检测FGF21在不同生理或病理状态下基因水平和蛋白水平的表达量变化规律.实验结果显示,在全天24 h中,小鼠肝脏中FGF21在晚18点至21点,表达量显著升高,这可能与啮齿类动物傍晚活动加强及进食习性有关|FGF21在饥饿后表达量显著升高,在饥饿后喂食FGF21的表达量下降,并且随着饥饿时间的延长,FGF21的表达量升高,说明FGF21与饥饿程度呈正相关|灌注葡萄糖后20 min内,FGF21的表达量下降,而灌注脂肪乳20 min内,FGF21的表达量上升,说明葡萄糖是FGF21的负调节因子,而脂肪乳是FGF21的正调节因子|利用谷氨酸钠造模的肥胖小鼠,肝脏中FGF21的表达量显著高于同龄对照组,说明肥胖可诱导FGF21高表达.综上所述,FGF21的表达量变化与小鼠夜间活动取食、饥饿程度、饮食中不同的成分以及肥胖有关.
  • 李丹彤, 林春江, 侯小杭, 李伟
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 850-857.
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    为了探索条斑紫菜凝集素(Porphyra yezoensis Ueda lectin, PYL)的作用机理,对其进行了分离和纯化.条斑紫菜经磷酸盐缓冲液浸泡、20%~75%硫酸铵分级、DEAE纤维素52离子交换层析和Sephadex G-200凝胶过滤层析,得到PYL纯品. Sephadex G-200分子筛层析测得其分子量为63.2 kD,在非还原SDS-PAGE上显示1条蛋白染色带,分子量为63.1 kD,还原SDS-PAGE显示1条蛋白染色带,亚基分子量为15.8 kD.PYL在对兔、大鼠、鸡、羊、狗血细胞的凝集作用中,对大鼠红细胞的凝集活性最高.PYL在pH 6.50~10.53范围内均有活性,在pH 8.40~8.91活性最高.经42 ℃热处理10 min后,仍然对大鼠红细胞血凝活性保留12.5%,其活性最大温度范围为4 ℃~20 ℃, 48 ℃加热10 min后,其活性完全丧失.EDTA对PYL的凝集活性有抑制作用,最小抑制浓度为156 mmol/L,而 Ca2+和Mg2+未发生凝集抑制现象.PYL凝集大鼠红细胞的作用不被D果糖、葡萄糖、D-半乳糖、D-甘露糖、菊粉、γ球蛋白、牛甲状腺球蛋白等所抑制,但可被蔗糖和麦芽糖抑制,最小抑制浓度蔗糖为20 mmol/L,麦芽糖为40 mmol/L.用N溴代丁二酰亚胺(NBS) 对PYL分子中的Trp残基进行化学修饰,有2.1个Trp残基被修饰,修饰后PYL活性丧失, 表明Trp残基是PYL凝集活性所必需的基团.
  • 庄志凯, 吉宏武
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 858-863.
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    以凡纳滨对虾 (Litopenaeus vannamei shrimp) 虾头为原料,采用Q- Sepharose F F和Sephadex G-150对虾头内源碱性蛋白酶进行了纯化,通过SDS-PAGE测定分子量为79.95 kD|采用DEAE-Sepharose F.F和Sephadex G-100对内源酸性蛋白酶进行了纯化,通过SDS-PAGE测定分子量为27.45 kD. 利用HPLC-ESI-MS/MS对虾头内源碱性和酸性蛋白酶同源性进行了初步分析,将检测到内源性蛋白酶的部分氨基酸序列分别与不同物种的胰蛋白酶和胃蛋白酶氨基酸序列于Vector NTI suite 8.0软件上进行序列比对. 结果表明,内源性碱性蛋白酶与猪胰蛋白酶具有很高的同源性,均含有氨基酸序列LSSPATLNSRVATVSLPR|内源性酸性蛋白酶与非洲蟾蜍胃亚蛋白酶具有很高的同源性,均含有氨基酸序列EFGLSETEPGTNF.
  • 技术与方法
  • 贺晓辉, 王丽珺, 周梅, 韩荣成, 郑强, 杨业鹏, 沙印林
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 864-869.
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    应用双歧双歧杆菌作为量子点输送载体,为小动物在体生物肿瘤成像提供依据. 采用电穿孔方法,将
    二棕榈酰磷脂酰胆碱(DPPC)包被的硫硒镉水溶性量子点转入细菌内,得到“量子点-细菌”复合探针,在
    “量子点-细菌”表面通过1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 (EDC)活化法进一步偶联叶酸分子,制得
    “量子点-细菌-叶酸”复合纳米生物探针. 将纳米生物探针经尾静脉注入Lewis肺癌小鼠体内,采用冰冻组
    织切片,考察探针在小鼠体内脏器及肿瘤的分布情况. 结果表明,在肿瘤部位检测到较强的量子点光致发光
    信号,而在肺、肝、脾等脏器中只检测到微弱的量子点发光信号. “量子点-细菌-叶酸”复合纳米生物探
    针小动物在体肿瘤靶向成像是可行的.
  • 廖智, 李楠楠, 王信超, 孙敬敬, 申望, 范美华, 石戈
    中国生物化学与分子生物学报. 2012, 28(9): 870-878.
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    贻贝通过足腺分泌特有的足丝并以此粘附于水下各种基质表面.贻贝足丝中富含各种粘附蛋白,其优异的水下粘附性能使其成为开发新型生物粘合剂的候选分子.厚壳贻贝足丝粘附能力强,本文采用尿素及盐酸胍抽提结合二维双向电泳技术(two-dimensional electrophoresis, 2-DE),分别对厚壳贻贝足丝纤维和足丝盘的蛋白质进行分离及染色;采用串联质谱技术结合常规搜库和表达序列标签(EST) 数据库搜索,对分离获得的蛋白质点进行鉴定,从中获得了mfp-3、mfp-6、胶原蛋白以及3种未曾报道过的新型贻贝足丝蛋白成分.上述研究为深入了解厚壳贻贝足丝蛋白的分子多样性、探讨其粘附机理以及从中筛选具有应用前景的贻贝足丝蛋白奠定了基础.