研究简报
杨丽萍,卢迈新,叶星,朱华平,高风英,莫媛媛,,黄樟翰
中国生物化学与分子生物学报.
2010, 26(05):
484-490.
参照已报道的鱼类线粒体基因序列, 通过PCR扩增与测序, 获得了全长为16 627 bp的尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列, 共编码13种蛋白质基因、2种rRNA基因、22种tRNA基因和1段控制区序列. H-链碱基组成具有明显的AT偏向性. 由H-链编码的蛋白质基因在第3位密码子上相对于前2个密码子具有一定的G排斥性. L-链编码蛋白质基因在碱基组成上与H-链编码基因存在差异. 编码基因除COI以GTG作为起始密码子外, 其它均以ATG起始. 终止密码子有2种, 分别为不完全T-或TA-和TAA. L-链复制起始区位于WANCY区域(tRNATrp - tRNAAla - tRNAAsn - tRNACys - tRNATyr)的tRNAAsn和tRNACys基因间, 长度为33 bp. 系统发育分析显示, 源于非洲的口孵鱼属、蓝首鱼属和球丽鱼属聚为单系群, 其中口孵鱼属莫桑比克罗非鱼先与同属罗非鱼KM-2006聚类后再与尼罗罗非鱼聚类.