环状RNA(circular RNAs, circRNAs)是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的非编码RNA，具有结构稳定和组织特异性表达等特征. 有些circRNA分子富含微小RNA结合位点，可通过充当竞争性内源RNA的角色来发挥作用，如CDR1as对miR-7的海绵作用与肺癌、乳腺癌、胶质瘤及肌萎缩性脊髓侧索硬化等疾病发生相关. cANRIL可通过影响多梳家族参与动脉粥样硬化的发生. 大量circRNA的发现及其结构和功能的阐明不仅可以使我们更加深入地了解疾病的发生机制，而且为相关疾病的预防、诊断和治疗提供了新的方向.
MicroRNA(miRNA)是一类小的非编码RNA，它们主要在转录后水平对靶mRNA进行切割或抑制mRNA的翻译来调控基因的表达. miRNA通过对靶基因的调控参与植物的生长发育、胁迫应答和代谢过程.在水稻中，已经发现并初步验证了许多与生长发育相关的miRNA，它们对水稻不同器官和形态发育发挥着重要作用.本文综述了水稻miRNA的发生和调控机制、靶基因的预测，重点介绍了miRNA对水稻生长发育和形态建成的研究进展，并对研究过程中存在的问题进行了讨论.为更好地了解miRNA及其靶基因在提高水稻产量和品质方面的作用，进一步解析miRNA在水稻中的调控机制提供参考.
动物转基因技术可以突破物种与年龄界限，有针对性地创造遗传变异.但是在转基因过程中，非目的序列的残留可能对后续研究造成障碍，甚至形成安全隐患.因此，对动物基因组进行无痕修饰的重要性日益凸显. 基因组无痕修饰目前主要有两套策略.一是人工核酸酶的非整合导入，这主要是通过RNA或蛋白质的形式实现，可有效避免核酸酶质粒DNA的残留.二是转基因载体的优化及整合后删除，它是借助Piggybac系统, 对末端重复单元之间的序列进行精确切离.本文总结了动物基因组无痕修饰的研究现状，并对其存在问题和应用前景做出评述，以期对我国的动物转基因研究和家畜转基因育种提供有益的参考和借鉴.
长期以来雌性脊椎动物的性别分化被认为是一个“默认”的程序.但是近些年研究发现,Rspo1基因的突变或缺失可导致哺乳动物XX型个体性反转为雄性.Rspo1在鱼类、两栖爬行类、鸟类和哺乳类动物性腺发育的不同阶段表达，其表达在雌雄个体性别分化时期有差异，是潜在的性别调控基因.Rspo1在性别发育早期可通过Wnt/β-catenin信号通路调控性腺分化相关因子的表达，影响原始生殖细胞分裂增殖、细胞周期和生长发育，参与调控性腺中体细胞的分化.本文总结了近年来Rspo1在脊椎动物中的表达调控及其在雌性性别决定方面功能的研究进展.
铁离子是几乎所有生物包括细菌生存必需的营养元素. 在宿主体内，绝大多数的铁离子均以血红素的形式存在于各种血红素结合蛋白，如血红蛋白、肌红蛋白等. 当致病菌感染宿主后，血红素将成为某些致病菌主要的铁离子来源. 致病菌编码血红素转运系统，并利用该系统将血红素转运至胞浆，在胞浆血红素被细菌的血红素降解蛋白降解，释放铁离子供细菌利用. 在致病菌中,目前至少有两种血红素降解酶被发现和鉴定. 第一种为经典的血红素氧化酶(heme oxygenase, HO)，它催化血红素氧化形成胆绿素、一氧化碳(CO)和Fe2+;第二种非经典降解酶,包括金黄色葡萄球菌的IsdG/IsdI蛋白及其同系物MhuD蛋白，催化血红素分别产生staphylobilin和mycobilin. 另外，部分细菌内存在其它血红素降解因子，其与前两种血红素降解酶无结构同源性，但在血红素降解实验中可产生胆绿素(biliverdin)或CO，因而被鉴定为“血红素降解蛋白”. 对细菌血红素降解蛋白分子结构解析及作用机制的深入理解，将有助于新的血红素降解蛋白的发现和鉴定.
脂肪酰基辅酶A氧化酶1（acyl-coenzyme A oxidase 1，Acox1）缺失可通过内源性配体激活过氧化物酶体增殖物激活受体α（peroxisome proliferator-activated receptor-α，PPARα）及其调控的信号通路，从而减轻肥胖基因leptin突变型（ob/ob）小鼠的肥胖和脂肪肝症状，但提高了其肝癌发生率. 为进一步研究PPARα信号通路在高脂日粮和leptin缺失诱导的脂肪肝形成过程中的作用，本研究以野生型、Acox1-/-、ob/ob和Acox1Δob/ob小鼠为模型，用正常日粮或60%高脂日粮饲喂10个月. 结果显示，正常日粮或高脂日粮饲喂情况下，Acox1-/-和Acox1Δob/ob小鼠的体重、白色脂肪细胞体积、棕色脂肪组织含量及肝脏脂肪含量均分别显著低于WT和ob/ob小鼠. 溴化脱氧尿嘧啶核苷（Brdurd）及烯酰辅酶A水合酶（L-PBE）免疫组化染色结果显示Acox1-/-和Acox1Δob/ob小鼠肝脏内肝细胞增殖及L-PBE活性、肝脏重量及其占体重的百分比均显著高于WT和ob/ob小鼠. 正常日粮饲喂的WT、Acox1-/-、ob/ob和Acox1Δob/ob小鼠肝癌发生率分别为0%、100%、0%和4%，高脂日粮饲喂后，其肝癌发生率分别为0%、100%、29%和100%. Q-PCR结果显示Acox1-/-和Acox1Δob/ob小鼠肝脏内L-PBE、Cyp4a3、Akr1b10、ap2等基因的表达水平显著高于WT和ob/ob小鼠. 综上所述, PPARα信号通路激活可以抵抗高脂日粮和leptin缺失诱导的肥胖和脂肪肝，但脂质过氧化反应可能通过Nrf2-Akr1b10信号通路促进了肝癌发生.
岩藻糖基转移酶IV（fucosyltransferase IV，FUT4）是催化蛋白质岩藻糖基化的关键酶．已经证明，FUT4-siRNA能够抑制鳞癌细胞的增殖．5-氮杂-2-脱氧胞苷（5-aza-dC）是临床常用化疗药物，但5-aza-dC是否对鳞癌有治疗作用，以及与FUT4-siRNA联合使用能否加强对鳞癌细胞增殖和迁移的抑制尚不清楚．本研究以鳞癌细胞系A431和SCC12为对象，探讨5-aza-dC及其与FUT4-siRNA联合使用对细胞增殖和迁移的影响．MTT结合流式细胞周期分析显示，5-aza-dC处理A431和SCC12细胞4 d后，细胞增殖被明显抑制，抑制率分别为18%和20% (P<0.05)；与对照组比较，加药处理组G1期细胞数量减少，S期细胞数量明显增加．Western印迹结果揭示，A431细胞FUT4表达水平较SCC12细胞高．经5-aza-dC处理后SCC12细胞FUT4表达有所增加，但仍低于A431细胞中的表达．FUT4-siRNA转染结合台盼蓝活细胞记数证明，FUT4-siRNA明显降低细胞FUT4表达，5-aza-dC处理同时转染FUT4-siRNA的A431和SCC12细胞增殖进一步被抑制，抑制率分别为54%和60% (P<0.05)．细胞划痕法显示，5-aza-dC与FUT4-siRNA联合使用，对细胞迁移能力的抑制作用比5-aza-dC单独使用增强．上述结果提示，5-aza-dC通过诱导细胞S期阻滞抑制鳞癌细胞增殖，FUT4-siRNA与5-aza+dC联合使用可加强对细胞增殖和迁移的抑制．
激活Hedgehog信号通路可抑制间充质干细胞成脂分化，但抑制Hedgehog信号通路是否可促进脂肪细胞分化研究结果却并不一致.本研究采用环靶明诱导C3H10T1/2细胞成脂分化，并以国际公认的成脂诱导剂混合物（胰岛素、地塞米松、吲哚美辛和IBMX）诱导细胞分化作为参考. qRT-PCR结果显示，在10 μmol/L环靶明(cyclopamine)处理的C3H10T1/2细胞中，Hedgehog信号通路各基因相对表达量显著下降，而成脂分化调控基因PPARγ，C/EBPα和成脂分化标志基因FABP4相对表达量显著升高（P < 0.05). 与此一致，Western印迹结果表明，在环靶明处理的C3H10T1/2细胞中，Hedgehog信号通路中的Shh蛋白和Gli1蛋白表达水平显著下降，成脂分化相关的PPARγ、C/EBPα和FABP4蛋白表达水平显著升高（P < 0.05）. 此外，油红O染色方法证明,环靶明处理可诱导C3H10T1/2细胞成脂分化.以上研究结果提示，抑制Hedgehog信号通路对小鼠胚胎间充质干细胞的成脂分化具有促进作用，并可能为瘦肉型猪的培育和猪肉品质调控研究提供参考依据.
过氧化物酶体增殖物激活受体γ（peroxisome proliferator-activated receptor γ，PPAR-γ）通路是调节替换活化的(alternatively activated) M2型巨噬细胞极化的中心环节.姜黄素是PPAR-γ的天然激动剂，有着良好的抗炎作用.本研究通过建立巨噬细胞株的体外炎症模型,用姜黄素及PPAR-γ的特异性抑制剂GW9662对其进行干预，观察巨噬细胞株极化状态的改变.结果显示，姜黄素可以促使巨噬细胞向M2型极化，当特异性抑制PPAR-γ通路后，姜黄素促进巨噬细胞向M2型极化的作用受到抑制. 结果表明,姜黄素可能是通过激动PPAR-γ通路促使巨噬细胞向M2型极化，为进一步研究姜黄素的抗炎机制及治疗慢性低度炎症相关的代谢性疾病提供了一个新的思路.
绿色杜氏藻是研究耐盐机理的模式绿藻．葡萄糖不仅是营养物质，而且还是信号物质．目前，对绿色杜氏藻转录组、糖处理后差异表达基因和β-胡萝卜素生物合成途径关键基因表达还不清楚．本研究通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序,获得葡萄糖处理和未处理绿色杜氏藻转录组信息．利用P value值和差异倍数对样本进行差异表达分析，共111条转录本存在差异表达，3条为上调转录本，108条为下调转录本．利用RT-qPCR检验差异表达分析的准确性. 结果表明，转录本表达结果与转录组分析结果一致．GO功能富集结果表明，71条下调转录本与代谢相关,占所有下调转录本的65.74%．KEGG富集分析结果表明，21条KEGG通路含89条下调转录本，14条通路与代谢相关．代谢中通路最多的为能量代谢（6条），含63条下调转录本．能量代谢中与光合作用相关的下调转录本最多，为29条．通过分析找到2条与β-胡萝卜素生物合成相关通路（MVA/MEP途径及β-胡萝卜素合成途径），并发现通路的关键基因hmgs、dxs、dxr、psy、pds、chyb，对其进行差异表达分析，均不存在差异表达．研究表明,葡萄糖抑制了绿色杜氏藻光合作用，代谢受阻，但未影响β-胡萝卜素生物合成相关通路及关键基因．
RNA结合蛋白AUF1（AU-富含元件结合/降解因子）通过结合并促进抑癌基因p16 mRNA降解来抑制p16表达.然而，AUF1-p16调控过程在肿瘤发生发展过程中的意义有待探讨.本研究用Western印迹与RT-PCR技术分别检测临床50例患者低分化胃腺癌组织和癌旁组织细胞中AUF1和p16蛋白、p16 mRNA的表达情况，并分析其关联性；用RNA Pull-down技术检测其AUF1与p16 mRNA的结合情况.结果显示，低分化胃腺癌组织AUF1蛋白表达水平明显增高，且与p16蛋白和p16 mRNA相对表达水平呈负相关；RNA pull-down分析结果显示，癌组织AUF1与p16-3′UTR的结合活性明显强于癌旁组织. 提示AUF1-p16调控过程可能是低分化胃腺癌组织p16水平降低的重要机制.
贻贝足丝是贻贝足组织分泌的足丝蛋白形成的非细胞组织，具有在水环境下的极强粘附性能，是当前生物粘附剂及抗腐蚀材料的研发热点．为进一步了解贻贝足丝蛋白的分子多样性特征，采用新一代Illumina高通量测序平台对厚壳贻贝(Mytilus coruscus)足组织进行转录组测序，首次构建了厚壳贻贝足组织的转录组数据库．共计获得7 199 799 840 nt的碱基数据经过序列拼接和组装，获得88 825条unigene．对上述unigene开展了序列注释，共计37 007条unigene获得注释．在此基础上，经序列检索和比对，从中筛选出与目前已知的11种足丝蛋白同源的56条unigene序列并进行分析．结果表明,厚壳贻贝足丝蛋白具有明显的氨基酸偏好性,部分足丝蛋白具有重复序列，且厚壳贻贝足丝蛋白与其他种类的贻贝足丝蛋白具有较高的序列相似性．上述结果为后续贻贝足丝蛋白的批量鉴定以及在此基础上的贻贝足丝形成、固化以及粘附机制相关研究奠定了基础．
Ⅱ型启动子转录的外源短链RNA可以竞争性抑制细胞内源mRNA的核质转运，因而可能会提高植物RNA 病毒载体表达的外源基因在植物中的积累. 为了验证这一假说，利用OE-PCR技术合成拟南芥U6-1核内小RNA序列，并构建其Ⅱ型启动子转录的植物表达载体. 以农杆菌渗滤技术，与烟草花叶病毒（Tobacco mosaic virus, TMV）表达载体共接种寄主植物本氏烟，通过对报告基因绿色荧光蛋白（green fluorescence protein, GFP）的荧光观察，并以Western印迹和ELISA测定GFP在烟草中的表达情况，分析共表达Ⅱ型启动子转录的U6 RNA对外源基因在植物中表达的作用效果. 结果表明，共接种Ⅱ型启动子转录的U6 RNA对TMV病毒表达载体表达外源基因的水平有明显的增效作用，推测RNA核质转运干扰是提高外源基因表达的可能机制.
